Les données sont déjà dans tes tables. Si tu fais la mise à jour juste avant de passer à FSB2, t'auras pas besoin d'une mise à jour du script de FSB 1.0.x, puisque tu passera directement à FSB2 et c'est lui qui prendra la suite pour remplir la base.
En ce qui concerne la table fsb_messages_lus2, c'est une nouvelle table mais si tu regardes bien la requète, elle crée la table en y inserant les éléments de la tables fsb_messages_lus
CREATE TABLE `fsb_messages_lus_2` as
SELECT DISTINCT *
FROM `fsb_messages_lus`;